| Today's date: | 9/19/05 | ||||||||
| PCR name: | IL-6 | ||||||||
| Purpose: | Determine presence of hIL-6 transgene; does not distinguish one copy or two | ||||||||
| Samples: | |||||||||
| 1 | |||||||||
| 2 | |||||||||
| 3 | |||||||||
| 4 | |||||||||
| 5 | |||||||||
| # of rxns | |||||||||
| Reactions (ul): | X | 18 | Profile name: | IL-6 | |||||
| DNA | 1 | step | time (min:sec) | temp (C) | |||||
| H20 | 11.5 | 207 | 1 | 15:00 | 95 | ||||
| 10X buffer | 2 | 36 | 2 | :30 | 94 | ||||
| 4mM dNTPs | 1.5 | 27 | 3 | :20 | 60 | ||||
| 10pmol/ul primers | 4 | :45 | 72 | ||||||
| IL-6 upper | 1 | 18 | go to | step 2 | 39 times | ||||
| IL-6 lower | 1 | 18 | 5 | 10:00 | 72 | ||||
| GTGTAGGCACTGTCATCTG | 1 | 18 | 6 | hold | 4 | ||||
| MUP lower | 1 | 18 | |||||||
| 20 | ul | 342 | ul | ||||||
| + HotStar Taq | 0.18 | ul | 3.24 | ul | |||||
| Primers: | Sequence: (5' to3') | Tm | |||||||
| IL-6 upper | ACCTCTTCAGAACGAATTGACAAA | ||||||||
| IL-6 lower | AGCTGCGCAGAATGAGATGAGTTGT | ||||||||
| MUP upper | GTGTAGGCACTGTCATCTG | ||||||||
| MUP lower | CCAAGACATCGATGTGCTCC | ||||||||
| Products: | from allele(s) | length (bp) | digests? | primers | |||||
| internal control | all | 600 | MUP upper + MUP lower | ||||||
| hIL-6 Tg | IL6 | 450 | IL-6 upper + IL-6 lower | ||||||
| Genotypes: | bands | ||||||||
| +/+ | 600 | ||||||||
| IL-6/+ | 600, 450 | ||||||||
| IL-6/IL-6 | 600, 450 | ||||||||